Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSR3Q9UNL2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms