Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT84Q9NSB2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms