Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRCIN1Q9C0H9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRCIN1Q9C0H9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms