Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-219ENST00000552077 3293 ntTSL 216.09■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATG2A-202ENST00000418259 5654 ntTSL 516.05■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 UNK-206ENST00000589790 549 ntTSL 316.01■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ARHGEF7-210ENST00000449979 682 ntTSL 516.01■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PRSS53-202ENST00000486499 5489 ntTSL 215.97■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-222ENST00000592068 916 ntTSL 315.96■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.147e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM106A-207ENST00000592649 639 ntTSL 415.86■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D31-209ENST00000520368 653 ntTSL 415.85■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RAI1-206ENST00000583166 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.84■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 515.84■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANKS3-218ENST00000590803 2821 ntTSL 215.84■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-203ENST00000428632 2296 ntTSL 215.82■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KDSR-206ENST00000587292 569 ntTSL 515.77■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)15.76■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAF1C-204ENST00000544090 2747 ntTSL 215.73■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCBP2-202ENST00000411704 564 ntTSL 515.72■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MVK-215ENST00000636529 1509 ntTSL 515.67■□□□□ 0.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MARCH6-211ENST00000512449 832 ntTSL 515.65■□□□□ 0.17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-233ENST00000640039 1067 ntTSL 515.63■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CREBRF-206ENST00000523161 559 ntTSL 415.56■□□□□ 0.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D31-203ENST00000518099 1159 ntTSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.081e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MCF2L-205ENST00000397017 3903 ntTSL 515.47■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEIL1-208ENST00000565051 833 ntTSL 515.46■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-240ENST00000640507 1436 ntTSL 515.42■□□□□ 0.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MCF2L-211ENST00000413354 952 ntTSL 515.39■□□□□ 0.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 215.39■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZFP69B-203ENST00000469416 2382 ntTSL 215.38■□□□□ 0.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAF1C-217ENST00000566903 2628 ntTSL 515.34■□□□□ 0.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-229ENST00000639809 1118 ntTSL 515.32■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RPUSD3-215ENST00000475470 2413 ntTSL 215.29■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-219ENST00000467403 1661 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC135050.2-201ENST00000533518 2362 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GRB14-203ENST00000446413 1435 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNA-223ENST00000515459 757 ntTSL 515.23■□□□□ 0.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATG5-209ENST00000636335 1219 ntTSL 515.21■□□□□ 0.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP4-201ENST00000335271 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.2■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-242ENST00000640577 2436 ntTSL 515.17■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TIMM44-203ENST00000595831 1797 ntTSL 515.17■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ERGIC1-209ENST00000520642 539 ntTSL 415.13■□□□□ 0.011e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.017e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 07e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ST5-247ENST00000532871 463 ntTSL 315.08■□□□□ 07e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 07e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 07e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-219ENST00000639053 1778 ntTSL 515.06■□□□□ 07e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -07e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PXN-208ENST00000538144 1805 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -07e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-221ENST00000546053 508 ntTSL 314.99□□□□□ -0.017e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.017e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-213ENST00000542015 1002 ntTSL 314.94□□□□□ -0.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-202ENST00000475785 1717 ntTSL 514.94□□□□□ -0.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAGH-204ENST00000564445 864 ntTSL 314.91□□□□□ -0.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 314.81□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CSNK2A1-209ENST00000609606 589 ntTSL 214.8□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CSNK2A1-205ENST00000460062 552 ntTSL 414.8□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CSNK2A1-206ENST00000608066 577 ntTSL 414.8□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAUS8-207ENST00000598517 1055 ntTSL 514.78□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.5
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