RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640507.1

SPIN3-240, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-240ENST00000640507 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.82■■■■□ 3.81
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SPIN3-240ENST00000640507 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.72■■■□□ 2.83
SPIN3-240ENST00000640507 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.64■■■□□ 2.82
SPIN3-240ENST00000640507 NACADO15069 1562 aa32.64■■■□□ 2.82
SPIN3-240ENST00000640507 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.38■■■□□ 2.77
SPIN3-240ENST00000640507 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
SPIN3-240ENST00000640507 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.11■■■□□ 2.73
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SPIN3-240ENST00000640507 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.74■■■□□ 2.67
SPIN3-240ENST00000640507 SCRIBQ14160 1630 aa31.51■■■□□ 2.64
SPIN3-240ENST00000640507 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.41■■■□□ 2.62
SPIN3-240ENST00000640507 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
SPIN3-240ENST00000640507 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.88■■■□□ 2.53
SPIN3-240ENST00000640507 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.77■■■□□ 2.52
SPIN3-240ENST00000640507 NCAPD3P42695 1498 aa30.17■■■□□ 2.42
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SPIN3-240ENST00000640507 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
SPIN3-240ENST00000640507 SMARCA2P51531 1590 aa30.04■■■□□ 2.4
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SPIN3-240ENST00000640507 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.91■■■□□ 2.38
SPIN3-240ENST00000640507 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.88■■■□□ 2.37
SPIN3-240ENST00000640507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
SPIN3-240ENST00000640507 WIZO95785 1651 aa29.52■■■□□ 2.32
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SPIN3-240ENST00000640507 NESP48681 1621 aa29.49■■■□□ 2.31
SPIN3-240ENST00000640507 ERCC6Q03468 1493 aa29.48■■■□□ 2.31
SPIN3-240ENST00000640507 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.36■■■□□ 2.29
SPIN3-240ENST00000640507 CUX2O14529 1486 aa29.3■■■□□ 2.28
SPIN3-240ENST00000640507 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.29■■■□□ 2.28
SPIN3-240ENST00000640507 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.24■■■□□ 2.27
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SPIN3-240ENST00000640507 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.04■■■□□ 2.24
SPIN3-240ENST00000640507 CFTRP13569 1480 aa29.03■■■□□ 2.24
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SPIN3-240ENST00000640507 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.9■■■□□ 2.22
SPIN3-240ENST00000640507 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.88■■■□□ 2.21
SPIN3-240ENST00000640507 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.84■■■□□ 2.21
SPIN3-240ENST00000640507 WDR62O43379 1518 aa28.8■■■□□ 2.2
SPIN3-240ENST00000640507 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
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SPIN3-240ENST00000640507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SPIN3-240ENST00000640507 ABCC8Q09428 1581 aa28.41■■■□□ 2.14
SPIN3-240ENST00000640507 TOPBP1Q92547 1522 aa28.4■■■□□ 2.14
SPIN3-240ENST00000640507 IFT140Q96RY7 1462 aa28.31■■■□□ 2.12
SPIN3-240ENST00000640507 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.31■■■□□ 2.12
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SPIN3-240ENST00000640507 SOGA1O94964 1423 aa28.07■■■□□ 2.08
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SPIN3-240ENST00000640507 WDR97A6NE52 1622 aa27.84■■■□□ 2.05
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SPIN3-240ENST00000640507 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.75■■■□□ 2.03
SPIN3-240ENST00000640507 GRIN2BQ13224 1484 aa27.74■■■□□ 2.03
SPIN3-240ENST00000640507 TOP2BQ02880 1626 aa27.72■■■□□ 2.03
SPIN3-240ENST00000640507 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.72■■■□□ 2.03
SPIN3-240ENST00000640507 TRIM41Q8WV44 630 aa27.71■■■□□ 2.03
SPIN3-240ENST00000640507 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.7■■■□□ 2.03
SPIN3-240ENST00000640507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.69■■■□□ 2.02
SPIN3-240ENST00000640507 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
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SPIN3-240ENST00000640507 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
SPIN3-240ENST00000640507 CHD1O14646 1710 aa27.67■■■□□ 2.02
SPIN3-240ENST00000640507 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.6■■■□□ 2.01
SPIN3-240ENST00000640507 SYNJ2O15056 1496 aa27.6■■■□□ 2.01
SPIN3-240ENST00000640507 ARHGEF11O15085 1522 aa27.56■■■□□ 2
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SPIN3-240ENST00000640507 ADAMTS12P58397 1594 aa27.36■■□□□ 1.97
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SPIN3-240ENST00000640507 IGF1RP08069 1367 aa27.23■■□□□ 1.95
SPIN3-240ENST00000640507 CEP170Q5SW79 1584 aa27.21■■□□□ 1.95
SPIN3-240ENST00000640507 JPH4Q96JJ6 628 aa27.07■■□□□ 1.92
SPIN3-240ENST00000640507 SHROOM2Q13796 1616 aa27.05■■□□□ 1.92
SPIN3-240ENST00000640507 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.05■■□□□ 1.92
SPIN3-240ENST00000640507 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.04■■□□□ 1.92
SPIN3-240ENST00000640507 CUL7Q14999 1698 aa27.04■■□□□ 1.92
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