Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms