Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms