Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms