Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TOP2BQ02880 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TOP2BQ02880 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms