Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NMUP48645 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NMUP48645 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NMUP48645 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms