Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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CASQ1P31415 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASQ1P31415 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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