Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms