Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms