Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ZC2HC1AQ96GY0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ZC2HC1AQ96GY0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ZC2HC1AQ96GY0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ZC2HC1AQ96GY0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZC2HC1AQ96GY0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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