Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZC2HC1AQ96GY0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZC2HC1AQ96GY0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZC2HC1AQ96GY0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZC2HC1AQ96GY0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZC2HC1AQ96GY0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZC2HC1AQ96GY0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZC2HC1AQ96GY0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC2HC1AQ96GY0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZC2HC1AQ96GY0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1AQ96GY0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZC2HC1AQ96GY0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZC2HC1AQ96GY0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZC2HC1AQ96GY0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZC2HC1AQ96GY0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZC2HC1AQ96GY0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZC2HC1AQ96GY0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZC2HC1AQ96GY0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZC2HC1AQ96GY0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZC2HC1AQ96GY0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZC2HC1AQ96GY0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZC2HC1AQ96GY0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZC2HC1AQ96GY0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZC2HC1AQ96GY0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZC2HC1AQ96GY0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZC2HC1AQ96GY0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZC2HC1AQ96GY0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZC2HC1AQ96GY0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZC2HC1AQ96GY0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZC2HC1AQ96GY0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZC2HC1AQ96GY0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZC2HC1AQ96GY0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZC2HC1AQ96GY0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZC2HC1AQ96GY0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZC2HC1AQ96GY0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC2HC1AQ96GY0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1AQ96GY0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1AQ96GY0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1AQ96GY0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZC2HC1AQ96GY0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZC2HC1AQ96GY0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZC2HC1AQ96GY0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZC2HC1AQ96GY0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZC2HC1AQ96GY0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZC2HC1AQ96GY0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZC2HC1AQ96GY0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC2HC1AQ96GY0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZC2HC1AQ96GY0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZC2HC1AQ96GY0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZC2HC1AQ96GY0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZC2HC1AQ96GY0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZC2HC1AQ96GY0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZC2HC1AQ96GY0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZC2HC1AQ96GY0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC2HC1AQ96GY0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZC2HC1AQ96GY0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZC2HC1AQ96GY0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZC2HC1AQ96GY0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1AQ96GY0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZC2HC1AQ96GY0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZC2HC1AQ96GY0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1AQ96GY0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1AQ96GY0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC2HC1AQ96GY0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC2HC1AQ96GY0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC2HC1AQ96GY0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1AQ96GY0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZC2HC1AQ96GY0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZC2HC1AQ96GY0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC2HC1AQ96GY0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC2HC1AQ96GY0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC2HC1AQ96GY0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC2HC1AQ96GY0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC2HC1AQ96GY0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC2HC1AQ96GY0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC2HC1AQ96GY0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC2HC1AQ96GY0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC2HC1AQ96GY0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC2HC1AQ96GY0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZC2HC1AQ96GY0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZC2HC1AQ96GY0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1AQ96GY0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZC2HC1AQ96GY0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZC2HC1AQ96GY0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZC2HC1AQ96GY0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZC2HC1AQ96GY0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZC2HC1AQ96GY0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZC2HC1AQ96GY0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZC2HC1AQ96GY0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZC2HC1AQ96GY0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZC2HC1AQ96GY0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZC2HC1AQ96GY0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZC2HC1AQ96GY0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZC2HC1AQ96GY0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZC2HC1AQ96GY0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms