Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEIL1-212ENST00000567005 532 ntTSL 417.48■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DMWD-208ENST00000602829 655 nt17.47■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-220ENST00000639257 1009 ntTSL 317.47■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.387e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.371e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 517.34■□□□□ 0.372e-15■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNB1-206ENST00000492190 738 ntTSL 317.34■□□□□ 0.377e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-203ENST00000478405 1620 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.377e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AGTRAP-209ENST00000476512 942 ntTSL 317.33■□□□□ 0.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-220ENST00000468805 1721 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.367e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.357e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.343e-9■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.347e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GCAT-204ENST00000426858 558 ntTSL 417.18■□□□□ 0.347e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.347e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SLC39A9-205ENST00000554059 1763 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.347e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D16-204ENST00000571872 567 ntTSL 517.13■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CIZ1-218ENST00000476727 1205 ntTSL 517.11■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GCAT-207ENST00000478203 551 ntTSL 217.11■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WDR26-208ENST00000486652 2867 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TIMM44-206ENST00000598481 587 ntTSL 217.08■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-219ENST00000545492 657 ntTSL 217.08■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SLC35E1-210ENST00000600356 869 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DLAT-205ENST00000533297 2118 ntTSL 217.02■□□□□ 0.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BRAT1-204ENST00000469750 5226 ntTSL 216.95■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WWC2-207ENST00000508614 604 ntTSL 316.9■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NUP58-208ENST00000466694 1854 ntTSL 516.85■□□□□ 0.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOL4L-208ENST00000475781 1127 ntTSL 516.84■□□□□ 0.291e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.287e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.287e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.287e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 FARS2-204ENST00000602691 562 ntTSL 316.72■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-228ENST00000497805 1908 ntTSL 1 (best)16.72■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-203ENST00000439080 1388 ntTSL 216.7■□□□□ 0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 216.59■□□□□ 0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 UNK-208ENST00000592629 633 ntTSL 316.59■□□□□ 0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PIP4K2B-202ENST00000617499 547 ntTSL 416.56■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-228ENST00000639794 1681 ntTSL 516.53■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSC2-225ENST00000569110 1687 ntTSL 516.47■□□□□ 0.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WDR46-239ENST00000489905 1007 ntTSL 516.46■□□□□ 0.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.227e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.227e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.227e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 516.39■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SSBP4-213ENST00000602088 622 ntTSL 516.39■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HDAC10-211ENST00000476310 847 ntTSL 316.37■□□□□ 0.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM106A-206ENST00000592564 568 ntTSL 516.32■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-214ENST00000542867 848 ntTSL 516.32■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DLAT-204ENST00000531306 1766 ntTSL 216.24■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GOLGA4-203ENST00000419177 760 ntTSL 316.23■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.21■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRMU-210ENST00000470831 1860 ntTSL 216.21■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAF1C-208ENST00000563428 2531 ntTSL 216.2■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DHX9-206ENST00000483416 814 ntTSL 516.17■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CREBRF-202ENST00000517882 544 ntTSL 416.17■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-217ENST00000639000 2055 ntTSL 516.16■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 27.5
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 234 ms