Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP21-1Q3LI58 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms