Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPSQ13938 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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