Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ETV1P50549 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ETV1P50549 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ETV1P50549 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms