Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 418.54■□□□□ 0.563e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.113e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 TLK1-203ENST00000409443 2783 ntTSL 219.83■□□□□ 0.772e-20■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 TLK1-204ENST00000413010 603 ntTSL 519.18■□□□□ 0.662e-20■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-20■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-20■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 510.99□□□□□ -0.652e-20■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.612e-20■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.034e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.256e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)28.7■■■□□ 2.196e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.166e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 527.68■■■□□ 2.026e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 527.55■■■□□ 26e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 527.13■■□□□ 1.936e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 526.48■■□□□ 1.836e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 324.41■■□□□ 1.56e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 223.49■■□□□ 1.356e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 523.44■■□□□ 1.346e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 522.06■■□□□ 1.126e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 220.01■□□□□ 0.796e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 320.01■□□□□ 0.796e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 519.09■□□□□ 0.656e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 315.08■□□□□ 06e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 511.85□□□□□ -0.516e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SEMA4C-205ENST00000474420 2625 ntTSL 222.83■■□□□ 1.251e-12■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SEMA4C-204ENST00000467747 3371 ntTSL 217.31■□□□□ 0.361e-12■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.293e-13■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.213e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 PGP-202ENST00000562001 905 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SLC6A8-209ENST00000476466 470 ntTSL 315.76■□□□□ 0.113e-10■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 ASPSCR1-216ENST00000583503 641 ntTSL 320.2■□□□□ 0.824e-8■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SH2B1-209ENST00000563674 719 ntTSL 325.54■■□□□ 1.682e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.612e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.612e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SH2B1-212ENST00000567536 484 ntTSL 324.4■■□□□ 1.52e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.082e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.962e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.72e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 14.7
GTF2F1P35269 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.813e-9■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 FASN-210ENST00000636968 100 ntTSL 518.8■□□□□ 0.64e-14■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.642e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.592e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.332e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.962e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 NDOR1-205ENST00000612145 564 ntTSL 427.07■■□□□ 1.922e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 LTBP4-211ENST00000594537 657 ntTSL 524.5■■□□□ 1.514e-7■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RNF214-207ENST00000534428 548 ntTSL 224.12■■□□□ 1.452e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-235ENST00000567163 1356 ntTSL 523.78■■□□□ 1.42e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-219ENST00000564570 803 ntTSL 523.63■■□□□ 1.372e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RGS20-208ENST00000523064 610 ntTSL 1 (best)23.61■■□□□ 1.372e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CCDC137-206ENST00000575223 1888 ntTSL 523.56■■□□□ 1.362e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.362e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.362e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 LTBP4-227ENST00000600026 723 ntTSL 323.48■■□□□ 1.354e-7■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CCDC137-204ENST00000574107 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.41■■□□□ 1.342e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 LTBP4-224ENST00000599016 726 ntTSL 322.94■■□□□ 1.264e-7■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)22.81■■□□□ 1.246e-14■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.232e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.232e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.162e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 UBE2G2-209ENST00000491513 744 ntTSL 422.03■■□□□ 1.122e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-240ENST00000569176 966 ntTSL 221.81■■□□□ 1.082e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 UBE2G2-211ENST00000497630 933 ntTSL 221.64■■□□□ 1.052e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 LTBP4-208ENST00000593738 302 ntTSL 321.07■□□□□ 0.964e-7■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MZT2B-206ENST00000480182 480 ntTSL 1 (best)21.03■□□□□ 0.962e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-211ENST00000563368 755 ntTSL 320.98■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.782e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RGS20-210ENST00000523414 668 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.3■□□□□ 0.682e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MZT2B-204ENST00000455239 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.94■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 NDOR1-206ENST00000613750 1151 ntTSL 318.72■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CSNK1G2-204ENST00000589350 780 ntTSL 518.71■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-214ENST00000476771 584 ntTSL 518.4■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 318.24■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MZT2B-208ENST00000491178 234 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 UBE2G2-204ENST00000477954 1034 ntTSL 318.08■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-218ENST00000563794 818 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 MAN2C1-229ENST00000566013 775 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CLN6-215ENST00000636674 2005 ntTSL 517.31■□□□□ 0.362e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CNBP-210ENST00000512338 502 ntTSL 416.44■□□□□ 0.222e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 CLN6-219ENST00000637329 1204 ntTSL 516.22■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 14.6
GTF2F1P35269 RGS20-206ENST00000518286 455 ntTSL 315.95■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 14.6
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 124.6 ms