Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPGDP15428 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPGDP15428 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPGDP15428 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HPGDP15428 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPGDP15428 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPGDP15428 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms