Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGSM2O43147 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms