Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms