Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG2BQ96BY7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms