Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEBPEQ15744 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms