Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
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EEA1Q15075 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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EEA1Q15075 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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EEA1Q15075 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
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EEA1Q15075 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
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EEA1Q15075 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EEA1Q15075 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EEA1Q15075 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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