Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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