Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CCDC179H3BU77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CCDC179H3BU77 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms