Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX3A6NHT5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX3A6NHT5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms