Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STRN4Q9NRL3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms