Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms