Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC136Q96JN2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms