Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX3

WDR34, WD repeat-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR34Q96EX3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
WDR34Q96EX3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms