Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms