Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ANKS3-225ENST00000592421 1146 ntTSL 321.84■■□□□ 1.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GRB14-205ENST00000488342 1983 ntTSL 521.76■■□□□ 1.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GCAT-203ENST00000415371 552 ntTSL 421.63■■□□□ 1.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GCAT-205ENST00000445195 583 ntTSL 321.63■■□□□ 1.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SEPT9-218ENST00000587514 540 ntTSL 521.48■■□□□ 1.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BLCAP-207ENST00000414080 581 ntTSL 321.37■■□□□ 1.013e-9■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.997e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-244ENST00000640728 1954 ntTSL 521.22■□□□□ 0.997e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRMU-204ENST00000441818 1793 ntTSL 1 (best)21.22■□□□□ 0.997e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RPUSD3-205ENST00000427174 907 ntTSL 521.15■□□□□ 0.987e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 321.11■□□□□ 0.977e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.977e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PXN-220ENST00000637386 621 ntTSL 521.06■□□□□ 0.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-216ENST00000551096 530 ntTSL 420.98■□□□□ 0.957e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.947e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SEMA4B-212ENST00000559792 585 ntTSL 420.74■□□□□ 0.917e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC135050.2-202ENST00000532364 499 ntTSL 420.74■□□□□ 0.917e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-205ENST00000467019 504 ntTSL 420.71■□□□□ 0.917e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SLC35E1-203ENST00000436553 1343 ntTSL 320.68■□□□□ 0.97e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.97e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRMU-207ENST00000457572 1882 ntTSL 220.66■□□□□ 0.97e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.897e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NDUFS2-204ENST00000467295 1060 ntTSL 320.51■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-213ENST00000480978 844 ntTSL 220.46■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.857e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.857e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STRIP1-206ENST00000489059 546 ntTSL 220.32■□□□□ 0.847e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.837e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.827e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRMU-205ENST00000453630 1775 ntTSL 220.2■□□□□ 0.827e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.827e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 220.14■□□□□ 0.817e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRMU-203ENST00000381021 1830 ntTSL 220.13■□□□□ 0.817e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-211ENST00000477932 2450 ntTSL 520.12■□□□□ 0.817e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SDC1-205ENST00000447124 591 ntTSL 420.09■□□□□ 0.817e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRMU-206ENST00000456595 1688 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.87e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.87e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAP31-204ENST00000429550 684 ntTSL 320.03■□□□□ 0.87e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TIMM44-210ENST00000599939 2227 nt19.99■□□□□ 0.797e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TESC-203ENST00000470612 1057 ntTSL 219.95■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.787e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SEPT9-230ENST00000590586 572 ntTSL 419.88■□□□□ 0.777e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.777e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-216ENST00000554228 2555 ntTSL 519.86■□□□□ 0.777e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.777e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.767e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-212ENST00000549279 544 ntTSL 419.77■□□□□ 0.767e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.767e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.757e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TTLL4-203ENST00000415717 712 ntTSL 319.74■□□□□ 0.757e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RPUSD3-216ENST00000484134 2491 ntTSL 219.73■□□□□ 0.757e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.757e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-222ENST00000493805 603 ntTSL 419.68■□□□□ 0.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ALCAM-204ENST00000470756 1770 ntTSL 1 (best)19.66■□□□□ 0.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.737e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.737e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RPUSD3-202ENST00000418713 955 ntTSL 219.62■□□□□ 0.737e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CIZ1-221ENST00000488559 952 ntTSL 519.62■□□□□ 0.737e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.737e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.727e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 519.58■□□□□ 0.727e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ASPHD1-204ENST00000563177 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.51■□□□□ 0.717e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TTLL4-209ENST00000437755 747 ntTSL 319.41■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SHROOM1-204ENST00000440118 1080 ntTSL 219.41■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KDSR-208ENST00000589530 588 ntTSL 219.4■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-208ENST00000473172 665 ntTSL 319.38■□□□□ 0.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KDSR-212ENST00000592327 553 ntTSL 419.38■□□□□ 0.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-217ENST00000551099 570 ntTSL 419.34■□□□□ 0.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAF1C-219ENST00000568265 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 419.34■□□□□ 0.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RTEL1-210ENST00000496816 2222 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NDUFS2-208ENST00000478866 1076 ntTSL 219.24■□□□□ 0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.667e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAS4-204ENST00000463943 1498 ntTSL 1 (best)19.14■□□□□ 0.657e-6■■■■■ 27.5
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 158.8 ms