RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-210ENST00000599939 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.17■■■■■ 4.34
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TIMM44-210ENST00000599939 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
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TIMM44-210ENST00000599939 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.7■■■■□ 3.15
TIMM44-210ENST00000599939 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.69■■■■□ 3.14
TIMM44-210ENST00000599939 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.07■■■■□ 3.04
TIMM44-210ENST00000599939 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.98■■■■□ 3.03
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TIMM44-210ENST00000599939 SCRIBQ14160 1630 aa33.6■■■□□ 2.97
TIMM44-210ENST00000599939 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
TIMM44-210ENST00000599939 NACADO15069 1562 aa33.22■■■□□ 2.91
TIMM44-210ENST00000599939 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33■■■□□ 2.87
TIMM44-210ENST00000599939 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.97■■■□□ 2.87
TIMM44-210ENST00000599939 HRCP23327 699 aa32.9■■■□□ 2.86
TIMM44-210ENST00000599939 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.86■■■□□ 2.85
TIMM44-210ENST00000599939 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.85■■■□□ 2.85
TIMM44-210ENST00000599939 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.76■■■□□ 2.83
TIMM44-210ENST00000599939 TRIM41Q8WV44 630 aa32.62■■■□□ 2.81
TIMM44-210ENST00000599939 WIZO95785 1651 aa32.6■■■□□ 2.81
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TIMM44-210ENST00000599939 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
TIMM44-210ENST00000599939 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.29■■■□□ 2.76
TIMM44-210ENST00000599939 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
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TIMM44-210ENST00000599939 SMARCA4P51532 1647 aa32.17■■■□□ 2.74
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TIMM44-210ENST00000599939 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
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TIMM44-210ENST00000599939 SMARCA2P51531 1590 aa31.93■■■□□ 2.7
TIMM44-210ENST00000599939 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.92■■■□□ 2.7
TIMM44-210ENST00000599939 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.82■■■□□ 2.68
TIMM44-210ENST00000599939 ABCC8Q09428 1581 aa31.81■■■□□ 2.68
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TIMM44-210ENST00000599939 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.6■■■□□ 2.65
TIMM44-210ENST00000599939 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
TIMM44-210ENST00000599939 SOGA1O94964 1423 aa31.47■■■□□ 2.63
TIMM44-210ENST00000599939 EEA1Q15075 1411 aa31.37■■■□□ 2.61
TIMM44-210ENST00000599939 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.32■■■□□ 2.6
TIMM44-210ENST00000599939 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.32■■■□□ 2.6
TIMM44-210ENST00000599939 CEP162Q5TB80 1403 aa31.32■■■□□ 2.6
TIMM44-210ENST00000599939 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.3■■■□□ 2.6
TIMM44-210ENST00000599939 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.28■■■□□ 2.6
TIMM44-210ENST00000599939 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.25■■■□□ 2.59
TIMM44-210ENST00000599939 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
TIMM44-210ENST00000599939 SYNJ1O43426 1573 aa31.19■■■□□ 2.58
TIMM44-210ENST00000599939 GOLGA3Q08378 1498 aa31.13■■■□□ 2.57
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TIMM44-210ENST00000599939 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
TIMM44-210ENST00000599939 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.97■■■□□ 2.55
TIMM44-210ENST00000599939 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
TIMM44-210ENST00000599939 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
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TIMM44-210ENST00000599939 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.51■■■□□ 2.47
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TIMM44-210ENST00000599939 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.72■■■□□ 2.35
TIMM44-210ENST00000599939 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.64■■■□□ 2.33
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TIMM44-210ENST00000599939 MIER1Q8N108 512 aa29.63■■■□□ 2.33
TIMM44-210ENST00000599939 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.63■■■□□ 2.33
TIMM44-210ENST00000599939 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
TIMM44-210ENST00000599939 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.6■■■□□ 2.33
TIMM44-210ENST00000599939 NESP48681 1621 aa29.6■■■□□ 2.33
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