Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S1Q92572 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S1Q92572 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S1Q92572 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S1Q92572 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AP3S1Q92572 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms