Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSRNP3Q8WYN3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSRNP3Q8WYN3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms