Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APCDD1LQ8NCL9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms