Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
USP43Q70EL4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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