Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC36A4Q6YBV0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms