Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms