Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF5Q12774 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF5Q12774 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms