Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEFA1P59665 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms