Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GZMBP10144 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GZMBP10144 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GZMBP10144 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GZMBP10144 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GZMBP10144 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
GZMBP10144 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GZMBP10144 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GZMBP10144 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms