Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGAVP06756 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms