Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTDSP2O14595 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTDSP2O14595 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTDSP2O14595 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTDSP2O14595 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CTDSP2O14595 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTDSP2O14595 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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