Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TPRKBQ9Y3C4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms