Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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