Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MCMBPQ9BTE3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms